Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpl28P41105 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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