Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc11P31313 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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