Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm29272-201ENSMUST00000185476 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21919-201ENSMUST00000185653 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm28446-201ENSMUST00000186508 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm28680-201ENSMUST00000186743 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21824-201ENSMUST00000186810 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21862-201ENSMUST00000186957 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21796-201ENSMUST00000187116 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21795-201ENSMUST00000187263 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm28814-201ENSMUST00000187334 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21720-201ENSMUST00000187428 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm20827-201ENSMUST00000187928 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21766-201ENSMUST00000187962 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21837-201ENSMUST00000188117 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprmP28828 Gm21777-201ENSMUST00000189307 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm28247-201ENSMUST00000189329 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprmP28828 Gm21906-201ENSMUST00000189760 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprmP28828 Gm28879-201ENSMUST00000190973 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm21752-201ENSMUST00000191023 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprmP28828 Gm21813-201ENSMUST00000191291 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprmP28828 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtprmP28828 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtprmP28828 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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