Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl3P27659 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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