Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms