Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms