Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TP20293 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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TP20293 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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TP20293 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TP20293 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TP20293 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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