Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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