Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms