Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Itgb1P09055 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Itgb1P09055 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms