Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01735 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01735 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01735 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01735 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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