Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms