Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28048F7BCN0 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms