Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Smok3bC0HKC9 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smok3bC0HKC9 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smok3bC0HKC9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smok3bC0HKC9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smok3bC0HKC9 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smok3bC0HKC9 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smok3bC0HKC9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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