Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clrn2B2RVW2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clrn2B2RVW2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clrn2B2RVW2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clrn2B2RVW2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clrn2B2RVW2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clrn2B2RVW2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Clrn2B2RVW2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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