Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac5Q9Z2V6 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 470.5 ms