Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdpk1Q9Z2A0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms