Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms