Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Bank1-205ENSMUST00000198206 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm16578-201ENSMUST00000160797 784 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms