Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms