Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pop5Q9DB28 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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