Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tubgcp4Q9D4F8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms