Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Zbed3Q9D0L1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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