Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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