Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ddx28Q9CWT6 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 504.1 ms