Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
DenrQ9CQJ6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms