Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ciao1Q99KN2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms