Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms