Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cchcr1Q8K2I2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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