Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms