Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm28Q8CGC6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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