Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nup88Q8CEC0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms