Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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