Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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FarsaQ8C0C7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
FarsaQ8C0C7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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