Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms