Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms