Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms