Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zbtb40Q6PCS8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms