Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms