Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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