Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms