Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms