Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kdm4dQ3U2K5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms