Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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