Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Shcbp1lQ3TTP0 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms