Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pnisr-203ENSMUST00000108229 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm5315-201ENSMUST00000204430 1897 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms