Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpusd2Q149F1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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