Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms