Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC117608.1-202ENSMUST00000224074 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms