Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ccl7Q03366 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl7Q03366 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms